Operațiunea este supravegheată de Ministerul Apărării Naționale și face parte din planul guvernului federal de a extinde rolul căilor ferate dincolo de serviciile de transport de pasageri.
Operațiunile de transport de marfă sunt asigurate de o flotă de locomotive Wabtec ES44AC cu o putere nominală de 4.500 CP. Locomotivele, identificate ca TMY 2004, 2005 și 2006, au fost utilizate pentru manevre de cuplare și poziționarea inițială a platformelor intermodale.
Trenurile de marfă sunt echipate cu Sistemul european de management al traficului feroviar (ERTMS), care permite funcționarea alături de infrastructura existentă pentru pasageri. Integrarea are ca scop permiterea utilizării coordonate a liniei, menținând în același timp standardele comune de siguranță.
Testele sunt efectuate pe timp de noapte pe tronsonul care duce la Tenosique. Acestea includ amplasarea primelor platforme care vor susține lansarea serviciilor regulate de transport de marfă.
Proiectul Maya Train se întinde pe Peninsula Yucatán și a fost dezvoltat în principal ca o cale ferată pentru pasageri. Introducerea serviciilor de transport de marfă adaugă o funcție logistică coridorului, conectând zonele industriale și porturile din sud-estul Mexicului.